隔天，司马光再上《辞门下侍郎第二札子》，谈到熙宁三年（1070年）枢密副使的任命，说自己贪爱富贵与常人无异，所以终辞不拜，只因所言无足采纳。然后说：“未审圣意以臣前后所言，果为如何？若稍有可采，乞特出神断，力赐施行，则臣可以策励疲驽，少佐万一。若皆无可采，则是臣狂愚无识，不知为政，岂可以污高位，尸重任，使朝廷获旷官之讥，微臣受窃位之责？”司马光的意思很明白，就是说如果我提的建议尚可采纳，就请施行出来，我愿意就任；如果无可采纳，那可万万不敢从命。
058从这个奏疏我们还可以得知，当天太皇太后派中使梁惟简赐手诏，说：“赐卿手诏，深体予怀，更不多免。嗣君年德未高，吾当同处万务，所赖方正之士，赞佐邦国，想宜知悉，再宣谕。前日所奏乞引对上殿讫赴任，其日已降指挥，除卿门下侍郎，切要与卿商量军国政事。早来所奏，备悉卿意，再降诏开言路，俟卿供职施行。”太皇太后已经给出肯定的回答，司马光于是不再辞让。
元丰八年（1085年）五月以后，变法时期遭到排挤的一些官员，已被陆续召回京师或者恢复官职：五月初六日，诏苏轼官复朝奉郎、知登州。五月初七日，诏吕公著乘驿传进京。五月初八日，以程颢为宗正寺丞。（六月十五日，程颢卒。）六月十四日，以资政殿学士韩维知陈州；未行，召兼侍读，加大学士。六月十六日，以奉议郎、知安喜县事、清平人王岩叟，为监察御史。七月初六日，以资政殿大学士兼侍读吕公著，为尚书左丞。九月十八日，以秘书少监刘挚，为侍御史。同月，召朝奉郎、知登州苏轼为礼部郎中。